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等待郑成功的这半个月里，崇祯皇帝朱由检忙的很充实。
凤阳府集结的参将总兵以上全部到达南京，召开了大明历史上规模最为庞大的军事会议。
议题只有一个：成立军事统帅府。
成立军事统帅府，
下设：
兵政部：将官和兵士军功考核，提拔，刑狱，军纪督察。
军务部：军饷发放，抚恤发放，粮草运输，后勤保障，辎重管理。军官士兵退役伤残后续事宜，军官伤病退役的，担任地方部队主管或教官。士兵退役的担任民兵教官或民兵主官。
军械部：采购和生产军事物资，新武器研究。兵工厂管理。
军师总部：负责传达命令体系建设，情报收集，战略制定，战术制定，训练教官营
军师总部直辖：
特战部队三千人编制。
训练教官营五千人编制，所有军队教官，均有训练教官营下派，直属军事教官营管辖。
军师总部情报部，由锦衣卫对外司改编扩编，负责全军情报收集，敌对势力情报收集，情报人员发展，情报外围人员发展，并监察全军将领。
情报部情报官1-9级和情报员三级，
一级情报官有权调动：大军镇级别以下部队三万人以下，省级地方部队相当于军镇总镇级别。
二级至五级情报官情报官有权调动：省级级别以下一千人以下部队，省级地方部队，
六级-九级情报官：有权调动三百人以下部队，县级地方部队。
成立大明海军部，研究海上作战事宜
大明海军总督：路振飞
大明海军部下设：
船舶建造衙门，统筹所有船舶建造厂，船舶修理厂。
大明海军海战研究院
大明海军第一镇，代理总镇郑成功，负责东海以北海上防务，驻军地舟山群岛。人员两万人，海军陆战部队五千人，特战部队一千人。
大明海军第二镇，筹备中，负责舟山群岛以西，南海防务。
大明海军第三镇。筹备中，负责远洋作战。
军事统帅府成立马兵部
负责马匹繁育，马匹养殖，战马训练，骑兵训练，骑兵作战战术制定等等。
军事统帅府成立飞艇部，研究空中打击相关事宜。热气球和飞艇的研究和使用，
目前保密。
军事统帅府成立大明讲武堂，所有军官，包括现有总兵以下，必须进讲武堂学习一个月，根据学习成绩确定未来军职发展。
讲武堂下设：
军事韬略课，讲解宏观军事，军事谋略。
陆军战事战术课，讲解战争现场指挥，战役战阵，兵力布置，远程打击，近程进攻，肉搏战，攻城战术，守城战术，地雷战，地道战等。
军事后勤课，武器粮草运输管理，武器粮草保管管理，伙头兵管理，战场伙食输送管理等
海战课
飞天课。
军事统帅府成立：火油研究学院，研究火油军方的使用，民事使用。
军事统帅府成立：高级火炮部队，设火炮研究院，研究远程，超视距远程打击。
历任皇帝任军事统帅府大元帅
军事统帅府同知：孙承宗，负责日常管理
军事副元帅2人：黄得功，左良玉
军事统帅府军事参议五人：堵胤锡，
军事会议采取表决超过半数即可执行的议事规则。参加人员：大元帅，同知，副元帅，军事参议。皇帝有一票否决权。
经过激烈讨论，人员任命确定下来，
朱由检看了看王承恩道：“传旨吧。”
“奉天承运皇帝，召曰：
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