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第11章：
1“闽之奸徒，聚食于澳，教诱生事者不下二三万人。粤之盗贼，亡命投倚为患者，不可数计。”——出自《崇祯长编》崇祯三年五月条。
2在17世纪初期，全世界只有欧洲、明朝、日本在造船时用铁钉连接，其中日本用铁钉造船的历史不到100年，此前是学的朝鲜木钉造船，16世纪才从明朝学去铁钉造船。此外正如本章所言，从阿拉伯半岛到印度半岛都是用缝合船板技术，东南亚诸岛则是捆扎船。
3“余乡二三百里内，若辈皆好穿丝绸、绉纱，且色染大类妇人。生员读书人家，尽为女人红紫之服，此乱象也，余每见惊心骇目。近日改得古诗一首：昨日到城郭，归来泪满襟。遍身女衣者，尽是读书人。”——万历年间李乐《见闻杂记》
第12章：
1、“三十二年七月，西洋红毛番长韦麻郎驾三大艘至彭湖，求互市，税使高寀召之也。有容白当事，自请往谕。见麻郎，指陈利害。麻郎悟，呼寀使者，索还所赂寀金，扬帆去。”——出自《明史·沈有容传》，韦麻郎即威布兰德·范·沃韦克，是荷兰东印度公司前身老牌公司派往亚洲的第二支舰队的副司令，曾率荷兰商船首次抵达摩鹿加群岛的德那地，该岛和蒂多雷是全球仅有的两个丁香产地，为老牌公司带来了巨额利润。
2、“近日福建抽税太监寀，谬听方士言:‘食小儿脑千余，其阳道可复生如故’。乃遍买童稚潜杀之。久而事彰闻，民间无肯鬻者，则令人遍往他所盗至送入。”——出自沈德符《万历野获篇·食人》。此事在《明史》中亦有记载，称其“碎颅刳脑以食”。
3、“皇帝以吕宋久相商贾，不殊吾民，不忍加诛。又海外争斗，未知祸首。又中国四民商贾最贱，岂以贱民兴动兵革。又商贾弃家游海，压冬不回，父兄亲戚共所不齿，弃之无所可惜，兵之反以劳师。终不听有司言，爰降旨特行令所在，遣使传谕尔等酋长部落，令咸改悔，畏天守善，其海外戕杀姑不穷治。尔等当思皇帝浩荡之恩，中国仁义之大。”——出自万历三十一年马尼拉大屠杀当事福建巡抚徐学聚《报取回吕宋囚商疏》。
第13章：
“又据千总陈士瑛禀称：蒙差同洋商黄合兴二船往咬留吧宣谕，至三角屿遇夷船四只，称咬留吧王已往阿南国去，未得回文。又发夹板船五只，直抵彭湖，要来互市。黄合兴力止不允，拨番七名，将二船同夷船齐进大泥。瑛等谒大泥王。大泥酋称：‘咬留吧酋各处吊回夹板船，要往彭湖，若不允市，必动干戈’。盖阿南即红夷国，而咬留吧、大泥皆番种结连，情形昭然可睹。”——出自《明季荷兰人侵据澎湖残档》。
咬留吧即巴达维亚，荷兰东印度公司的亚洲总部，今印尼首都雅加达。大泥，即今泰国北大年，荷兰人在泰国最早的商馆于1602年在此设立。
黄明佐生平事迹史料不多，主要参考台湾学者翁佳音《十七世纪的福佬海商》一文。
第14章：
关于李国助的生平，最早进行考证的是日本学者岩成生一的《明末侨寓日本支那贸易商一官augustin李国助之活动——<华人甲必丹李旦考>补考》一文，但该文并没有考证出李国助的结局。
《荷兰平户商馆日记》中倒是记载了李国助之子的结局，原文是“1635年10月8日，海贼augustin之子因其父是海贼而被绑在十字架处死”，后人有猜测李国助在此之前已被郑芝龙除掉。
第15章：
1三百千即《三字经》、《百家姓》、《千字文》的合称，这三本启蒙书的重字率很低，共计有2200多个不同汉字，古代私塾都是一年内教完，学识字的效率比现代教育高得多。
2李国助所走的路线是日本朱印船贸易的西洋航线，据岩成生一考证，1604~1607年朱印船贸易遍及19个国家和地区，1607年后开始集中于交趾（安南阮主广南国）、东京（安南郑主北河国）、柬埔寨、暹罗（泰国）、高砂（台湾）、吕宋（菲律宾）等六处。
3澳门妈阁庙始建于弘治元年。嘉靖年间，葡人在浙江双屿的贸易基地被闽浙总督朱纨率军摧毁，遂辗转来此，询问当地居民此处的地名，却被误解成问庙名，答称“妈阁”。葡人遂音译为“macao”，于是便有了这个西文名字。
4无色无味的慢性毒药并不是武侠小说里才有，中世纪欧洲历史上就有用于宫廷阴谋的所谓“篡位粉”，实际上就是金刚石粉末，长期服用可致死。
第17章：
1根据最新发现的郑芝龙亲自主持编修的族谱，郑氏家族在福建安海传承十二代，开枝散叶人丁兴旺。早在郑芝龙之前好几代，郑氏族人就有很多以海贸为生，客死菲律宾、澳门、台湾等地的郑家人比比皆是。
2本章所言日荷外交摩擦即著名的滨田弥兵卫事件，关于荷兰人在日本幕府面前有多怂，英国人亚当·克卢洛专门写了一本书，书名是《公司与将军:荷兰人与幕府时代日本的相遇》。
3东番是明朝人对台湾的称呼，台湾这个名字来自荷兰人所居的大员，在清代才普遍用于称呼全岛。
4担是重量单位，1担就是100斤。
第18章：
1、“天启二年春，海贼谢天佑劫掠广海、电白各洋，多等自备船只，捉获贼首党孽百余人，缚送军门，金牌功票证。”——出自《报效始末疏》，收录于韩霖《守圉全书》。
该疏署名“委黎多”，即澳门议事会理事官（procurador），是现存最早的一份澳葡当局上奏明廷的中文奏章。疏中所言葡人助广东军门平海贼谢天佑事宜未见其他中文史料，在西文文献中记载此战共杀海盗1500余人，生擒数百。
2、“广中素无水寨之兵，遇有警急，方才召募兵船，委官截捕。夫贼起然后募兵，则卒非素练，安可必其决胜!贼灭而兵即散，则不旋踵而贼复入矣。”——出自吴桂芳《请设沿海水寨疏》，收录于《苍梧总督军门志》。
3、“闽五水寨，各有兵船，福、兴、泉、漳沿海地方不过十日之程，督府总戎檄书驰取官民船只，旬日可集。广中无水寨兵船，又道里辽远，一公文来往，非四五十日不能到。而东莞民间乌船，时出海南各处买卖，官取数十之船，非月余不能集。”——出自俞大猷《正气堂集》。
第19章：
1、“廉（州）为汉合浦郡，号珠海，多盗。”——出自申时行《赐闲堂集》
2、“雷、廉东洋海面，有乌料双桅广船一百余只，每犯杨梅、断网一带珠池，偷盗珠螺。”——出自《明神宗实录》
3、“安南叛贼范子仪、范子流等率众寇钦州，百户许镇与战于龙门港，死之。命都指挥俞大猷督兵勦之，伏诛。”——出自崇祯《廉州府志》
第20章：
1官厅是船长办公待客之所，一般位于艉楼一层，和上甲板平齐。尾大舱指的是船尾最大的舱室，一般位于上甲板之下水线之上，是船长的卧室。
2朱印船并不是一种船型，而是指获得幕府颁发的出洋贸易许可“异国渡海朱印状”的倭国海船。
朱印船里的中小型船只大多是福船，但是大型船只却多由倭国豪商自造，结合了福船、盖伦船、安宅船的特点。如荒木宗太郎的荒木船、末次平藏的末次船、角仓了以的角仓船、末吉孙左卫门的末吉船等。
本章末次船的尺寸参考嘉庆年间跑中日贸易的金全胜号福船：船身长4368米，宽1274米，深91米，吃水深468米，主桅364米，排水量975吨，载重量609吨。